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Estou considerando de ampliar meu plano de revenda de hospedagem e, nas considerações, levantei os fatores com os quais devo ter muito cuidado. E o principal deles: BACKUP. Pesquisei uma ferramenta no Joomla que realizasse tal tarefa e gostei das referências do Akeeba. E indo além nas considerações, pensei na possibilidade de mudar de servidor.

Mas e aí? Como faria para migrar o Joomla para outro servidor? Foi aí que descobri o post do Daniel Corrêa (MG) tratando o assunto. Ainda não foi necessário que eu fizesse tal migração, mas segue abaixo a íntegra do passo-a-passo caso esta seja a sua necessidade. Tenho certeza que será muito útil para mim também.
Agradecimento ao colega Daniel Corrêa.

O que ocorreu? Seus planos mudaram? O hosting não agradava? Então você precisará migrar seu site e não sabe como. Vamos aprender logo para não perder tempo, clientes e grana.

Geralmente os sites criados com o Joomla! usam componentes de terceiros - 3rd party - além dos componente Core. Esta explicação é válida para sites com componentes de terceiros e sem eles. Mas porque esta separação? Bom, se não tiver componentes de terceiros você precisará simplesmente de um export e um import do banco de dados e por isso não precisará seguir todos os passos abaixo obrigatoriamente. Basta instalar o Joomla! e executar os passo 2 e 5.

1. BackUp Total
   Realize um backup de todos os arquivos que estão dentro do diretório que seu Joomla! está instalado. Não esqueça nada para trás.
   Este backup pode ser feito via FTP ou pelo CPanel.
2. BackUp do Banco de Dados
   Dê um export na tabela do seu banco de dados a partir do PhpMyAdmin disponível no Cpanel.
   Se realizou com sucesso as duas tarefas acima você tem neste exato momento um backup completo, arquivos e banco de dados, do seu site.
3. Enviando arquivos para o novo servidor
   Os arquivos "backupeados" no 1º passo devem ser enviados, via FTP ou Cpanel, para o novo servidor.
4. ReConfigurando o configuration.php
   Após o envio dos arquivos ao servidor, abra o arquivo configuration.php, ele está na raiz do seus site, e altere as seguintes variáveis:
   
   $mosConfig_absolute_path: Este é o caminho absoluto no servidor do seu site. Algo parecido com: "/path/to/joomla".
   $mosConfig_cachepath: Este é o caminho absoluto do seu diretório de cache. Algo parecido com: "/path/to/joomla/cache".
   $mosConfig_live_site: É a URL do seu site. Não deixe de colocar o http:// e o www - http://www.seusite.com.br".
   $mosConfig_host: Esta é a localização no servidor de sua base MySQL. Geralmente é usado "localhost".
   $mosConfig_db: Nome do banco de dados MySQL.
   $mosConfig_user: Nome usuário do MySQL. Verifique se este usuário tem todos os privilégios ao seu banco de dados.
   $mosConfig_password: Senha do usuário do banco de dados MySQL.
   
   Caso tenha dúvidas sobre as informações acima solicite auxilio ao suporte de sua hospedagem, eles devem ajudá-lo.
5. Importando o Banco de Dados
   O arquivo SQL gerado no 2º passo deve ser importado pelo PhpMyAdmin, usando a opção Import.
6. Teste!
   Se os passos acima foram realizados com sucesso seu site está em funcionamento.

As informações acima foram explicadas de forma básica, apresentando somente a sequencia e o que deve ser feito para migrar um site Joomla! de servidor.

Fonte: http://www.joomlaminas.org/aprendendo/tutoriais/migrando-o-joomla-para-outro-servidor.html